Syrthiodd rhyfelwr ninja dewr i fagl a nawr mae ei fywyd mewn perygl. Byddwch chi yn y gĂȘm Ninja Jump & Run yn helpu'r arwr i oroesi a mynd allan ohono. Bydd angen i'ch arwr redeg ar lwyfannau sy'n ymddangos allan o unman ac yn cylchdroi yn y gofod. Bydd pob un ohonynt yn cael eu gwahanu gan bellter penodol. Felly, yn rhedeg hyd at ymyl un platfform, bydd yn rhaid i'r ninja neidio a hedfan trwy'r awyr i ddod o hyd i blatfform arall.